Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms