Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms