Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKQ9UM73 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms