Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC9Q9UKV0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms