Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH3Q9UHC1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms