Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms