Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDE1Q9NZC3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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