Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms