Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4L1Q9NU39 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms