Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms