Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DMRT3Q9NQL9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DMRT3Q9NQL9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms