Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AC087627.1-201ENST00000522339 993 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 LINC02251-201ENST00000554798 1224 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 MTND4P30-201ENST00000450281 899 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 COX7A2L-204ENST00000463055 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC025572.1-201ENST00000472243 553 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 RASA2-IT1-201ENST00000507770 612 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP3Q9H4L4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms