Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SENP6Q9GZR1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SENP6Q9GZR1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SENP6Q9GZR1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SENP6Q9GZR1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SENP6Q9GZR1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SENP6Q9GZR1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SENP6Q9GZR1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SENP6Q9GZR1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms