Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms