Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms