Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms