Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YTHDF1Q9BYJ9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms