Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACSIN1Q9BY11 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN1Q9BY11 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms