Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms