Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms