Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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