Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms