Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms