Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms