Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms