Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms