Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC74BQ96LY2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms