Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms