Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms