Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CMTM5Q96DZ9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms