Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPRTQ96BW1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms