Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR2Q969E8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms