Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms