Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms