Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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ZNF398Q8TD17 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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ZNF398Q8TD17 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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ZNF398Q8TD17 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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ZNF398Q8TD17 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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ZNF398Q8TD17 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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ZNF398Q8TD17 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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ZNF398Q8TD17 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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ZNF398Q8TD17 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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ZNF398Q8TD17 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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ZNF398Q8TD17 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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