Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00301Q8NCQ3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms