Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms