Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CLIP4Q8N3C7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CLIP4Q8N3C7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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CLIP4Q8N3C7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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