Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms