Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APTXQ7Z2E3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms