Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms