Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC73Q6ZRK6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms