Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms