Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSSK4Q6SA08 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms