Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms