Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNAPC4Q5SXM2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNAPC4Q5SXM2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAPC4Q5SXM2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAPC4Q5SXM2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAPC4Q5SXM2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAPC4Q5SXM2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAPC4Q5SXM2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAPC4Q5SXM2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAPC4Q5SXM2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAPC4Q5SXM2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAPC4Q5SXM2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAPC4Q5SXM2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNAPC4Q5SXM2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms