Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGD3Q5JSP0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms