Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms