Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GREB1Q4ZG55 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms