Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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